Paulo chega a Roma em 61, para aqui ser julgado pelo tribunal romano que o condenou à morte por ser cristão; a sentença foi proclamada numa localidade chamada "palude Salvia", em Roma. O seu corpo foi depositado a pouco mais de três quilômetros do lugar do martírio, no sepulcro que a cristã Lucina possuía na via Ostiense, que fazia parte do cemitério que ali existia. Foi possível sepultar o apóstolo Paulo numa necrópole romana, mesmo sendo ele cristão, por ser também cidadão romano. Seu túmulo logo se tornou objeto de veneração, sobre ele se edifica uma cella memoriae ou tropaneum, memorial para onde, durante esses séculos de perseguição, se dirigem em oração os fiéis e os peregrinos.
A lápide sepulcral
A 1,37 m abaixo do atual altar papal, uma lápide de mármore (2,12 m x 1,27 m) traz a inscrição:
PAULO APOSTOLO MART....
Ela é composta de diversas partes. A que traz o nome PAULO possui três orifícios, um redondo e dois quadrados.
O sarcófago
Foi sobre um sarcófago maciço de 2,55 m de comprimento por 1,25 m de largura e 0,97 m de altura que foram erguidos os “altares da Confissão” seguintes. Durante as reformas mais recentes, foi aberta uma grande janela sob o altar papal, para que os fiéis possam ver o túmulo do Apóstolo.
